Detalhe da pesquisa
1.
RNA promotes the formation of spatial compartments in the nucleus.
Cell
; 184(23): 5775-5790.e30, 2021 11 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34739832
2.
SARS-CoV-2 Disrupts Splicing, Translation, and Protein Trafficking to Suppress Host Defenses.
Cell
; 183(5): 1325-1339.e21, 2020 11 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33080218
3.
Higher-Order Inter-chromosomal Hubs Shape 3D Genome Organization in the Nucleus.
Cell
; 174(3): 744-757.e24, 2018 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29887377
4.
Long non-coding RNAs: spatial amplifiers that control nuclear structure and gene expression.
Nat Rev Mol Cell Biol
; 17(12): 756-770, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27780979
5.
Systems-level effects of allosteric perturbations to a model molecular switch.
Nature
; 599(7883): 152-157, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34646016
6.
Integrated spatial genomics reveals global architecture of single nuclei.
Nature
; 590(7845): 344-350, 2021 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33505024
7.
Quantification of the transferability of a designed protein specificity switch reveals extensive epistasis in molecular recognition.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(43): 15426-31, 2014 Oct 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25313039
8.
Coupling Protein Side-Chain and Backbone Flexibility Improves the Re-design of Protein-Ligand Specificity.
PLoS Comput Biol
; 11(9): e1004335, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26397464
9.
Computational protein design quantifies structural constraints on amino acid covariation.
PLoS Comput Biol
; 9(11): e1003313, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24244128
10.
Unraveling the Tcrb interactome.
J Exp Med
; 221(2)2024 Feb 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38284995
11.
Widespread protein aggregation as an inherent part of aging in C. elegans.
PLoS Biol
; 8(8): e1000450, 2010 Aug 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20711477
12.
Simultaneous mapping of 3D structure and nascent RNAs argues against nuclear compartments that preclude transcription.
Cell Rep
; 41(9): 111730, 2022 11 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36450242
13.
SPRITE: a genome-wide method for mapping higher-order 3D interactions in the nucleus using combinatorial split-and-pool barcoding.
Nat Protoc
; 17(1): 36-75, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35013617
14.
Single-cell measurement of higher-order 3D genome organization with scSPRITE.
Nat Biotechnol
; 40(1): 64-73, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34426703
15.
Computational design of a modular protein sense-response system.
Science
; 366(6468): 1024-1028, 2019 11 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31754004
16.
Structural analysis of the evolution of steroid specificity in the mineralocorticoid and glucocorticoid receptors.
BMC Evol Biol
; 7: 24, 2007 Feb 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17306029
17.
Flexible Backbone Methods for Predicting and Designing Peptide Specificity.
Methods Mol Biol
; 1561: 173-187, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28236238
18.
Xist recruits the X chromosome to the nuclear lamina to enable chromosome-wide silencing.
Science
; 354(6311): 468-472, 2016 10 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27492478
19.
A Web Resource for Standardized Benchmark Datasets, Metrics, and Rosetta Protocols for Macromolecular Modeling and Design.
PLoS One
; 10(9): e0130433, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26335248
20.
Flexible backbone sampling methods to model and design protein alternative conformations.
Methods Enzymol
; 523: 61-85, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23422426